出现射精疼痛主要是与生殖道的感染炎症有关，如前列腺炎和精囊炎等。另外，射精管出现结石梗阻和先天性梗阻也会造成射精疼痛。前者可以通过控制感染缓解，后者可以手术治愈。
男性在射精后出现轻度、短暂的会阴、腰骶部不适也不少见，多数能自行缓解。只有疼痛较剧烈，持续时间过长时才算是病态。生殖道感染炎症，(骨)盆底肌肉韧带充血、炎症等都可能造成这种状况。通常需要使用消炎镇痛ｙａｏ物，还可以进行理疗。
还有很多男性是在射精后排尿时，可能会出现尿细和尿道灼痛的状况，一般在数分钟至数十分钟内缓解。如果疼痛持续时间过长，应考虑尿道或前列腺感染炎症的可能，需要做相应的检查和治疗。
